判斷分公司是否在馬來西亞進行了實際運營和管理（Substance and Management）是一個重要的合規問題，尤其是在稅務和法律合規方面。以下是幾個關鍵標準和因素，可以用來判斷分公司是否在馬來西亞進行了實際運營和管理：

 1. 管理和決策中心

   - 董事會會議地點: 如果分公司的關鍵決策（如董事會會議、重大業務決策）主要在馬來西亞進行，這表明該公司在馬來西亞進行了實際的管理和運營。

   - 高ji管理層: 分公司是否在馬來西亞擁有駐地的高ji管理層（如首席執行官、財務總監等）也可以作為判斷標準。這些高管的日常工作地點應在馬來西亞，并且他們應在當地管理和執行公司的業務。

 2. 商業活動的實際開展

   - 業務運營: 分公司是否在馬來西亞實際開展其核心業務活動，比如生產、銷售、客戶服務或其他運營活動。這意味著公司在馬來西亞不僅僅是一個“信箱公司”（shell company），而是實質性地參與了當地的經濟活動。

   - 員工和辦公地點: 分公司是否在馬來西亞雇傭了足夠的員工并設立了實際的辦公地點。員工的數量和辦公設施的規模應與公司的業務性質和規模相符。

 3. 會計和財務管理

   - 財務管理地點: 分公司的財務和會計記錄是否主要在馬來西亞管理和保存。如果公司的財務管理、資金流動和會計工作都在馬來西亞進行，這表明公司在當地有實際的運營和管理。

   - 稅務申報和合規: 分公司是否在馬來西亞按時提交稅務申報，并遵守當地的稅務法律和法規。遵守馬來西亞稅務規定是證明公司在當地有實質性運營的一個重要標志。

 4. 日常運營和供應鏈

   - 供應鏈管理: 如果分公司在馬來西亞參與了整個或部分供應鏈的管理和運營（如采購、生產、物流等），這表明公司在當地進行了實際的商業運營。

   - 客戶和市場活動: 分公司是否在馬來西亞開展市場推廣、客戶服務和銷售活動，是否直接面向當地或區域市場提供產品或服務。

 5. 合同和法律文件

   - 合同簽訂地點: 分公司在馬來西亞簽訂的合同和協議，尤其是重要的商業合同，應在當地簽署和執行。這顯示公司在當地有實際的法律和商業存在。

   - 法律合規性: 分公司是否符合馬來西亞的公司法和其他相關法律法規，如年度審計、合規報告等。如果分公司在馬來西亞遵循了這些法律要求，通常表明公司在當地有實際的運營和管理。

 6. 銀行賬戶和資金管理

   - 銀行賬戶管理: 分公司是否在馬來西亞擁有和管理其銀行賬戶，并通過這些賬戶進行日常的資金管理和業務交易。如果公司在當地管理其財務資源，這表明其在馬來西亞有實質性運營。

   - 資金流動: 分公司是否在馬來西亞進行資金的接收和支付活動，以及是否通過當地銀行進行重大金融交易。

 7. 對外表現

   - 公眾形象和品牌: 分公司在馬來西亞是否有明確的市場存在，比如公司網站、廣告宣傳、本地聯系方式等，這些都表明公司在當地有實際的業務運營。

   - 客戶和供應商: 分公司是否有馬來西亞本地的客戶和供應商，這顯示其在當地的實際業務活動。